Postoje tri metode za programiranje CNC alatnog stroja: ručno programiranje, automatsko programiranje i CAD/CAM obradni centar.
Ručno programiranje
Ručno programiranje uključuje ručnu analizu crteža dijelova, tehnika obrade, izvođenje numeričkih izračuna, pisanje popisa programa te unos i provjeru programa. Pogodan je za obradu od točke-do-točke ili dijelova s relativno jednostavnom geometrijom; međutim, oduzima puno vremena-i sklono je pogreškama pri programiranju složenih dijelova.
Automatsko programiranje
Automatsko programiranje koristi računalo ili stroj za programiranje za dovršetak procesa stvaranja programa za dijelove, što je vrlo zgodno za složene dijelove.
CAD/CAM
CAD/CAM softver se koristi za postizanje automatskog programiranja na temelju modeliranja i slika. Najtipičniji softver je MasterCAM, koji može programirati operacije glodanja pomoću koordinatnih sustava s dvije-osi, tri-osi, četiri-osi i pet-osnih koordinatnih sustava, kao i tokarenje i žičanu eroziju. Iako ova vrsta softvera ima ograničenu funkcionalnost, jednostavan je za naučiti i relativno je jeftin.
